Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms