Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms