Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms