Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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UPB1Q9UBR1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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UPB1Q9UBR1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPB1Q9UBR1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms