Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms