Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms