Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms