Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms