Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms