Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms