Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDP1Q9NUW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDP1Q9NUW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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