Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms