Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCND1Q9NSA2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms