Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms