Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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