Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms