Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TUFT1Q9NNX1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUFT1Q9NNX1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms