Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms