Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTN4Q9HB63 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms