Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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