Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms