Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCD2Q9BXW9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCD2Q9BXW9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms