Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms