Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2Q9BX26 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms