Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms