Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms