Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms