Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms