Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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