Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms