Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD27Q96NW4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms