Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms