Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms