Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms