Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN23Q96B33 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN23Q96B33 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms