Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPTSSAQ969W0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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