Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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