Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms