Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYRIPQ8NFW9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYRIPQ8NFW9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms