Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC9Q8NEP7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC9Q8NEP7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms