Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDPD1Q8N9F7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms