Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms