Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLDN19Q8N6F1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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