Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLD3Q8IV08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms