Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00523Q86TU6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms