Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms