Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms