Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNDC1Q76NI1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNDC1Q76NI1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms