Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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