Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL2Q6F5E8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms